MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Candidatus Hamiltonella defensa 5AT (Acyrthosiphon pisum) chromosome

Total Repeats: 47511

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012751	TTA	2	6	12	17	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238897252
2	NC_012751	A	6	6	17	22	100 %	0 %	0 %	0 %	238897252
3	NC_012751	TTTA	2	8	25	32	25 %	75 %	0 %	0 %	238897252
4	NC_012751	T	6	6	44	49	0 %	100 %	0 %	0 %	238897252
5	NC_012751	TTC	2	6	55	60	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	238897252
6	NC_012751	T	6	6	154	159	0 %	100 %	0 %	0 %	238897252
7	NC_012751	AAT	2	6	247	252	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238897252
8	NC_012751	GCTC	2	8	339	346	0 %	25 %	25 %	50 %	238897252
9	NC_012751	AGAA	2	8	469	476	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_012751	AATTA	2	10	480	489	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_012751	AAAAG	2	10	490	499	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_012751	ATT	2	6	556	561	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_012751	T	7	7	560	566	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_012751	GTTT	2	8	567	574	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_012751	A	8	8	580	587	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_012751	A	6	6	607	612	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_012751	T	7	7	613	619	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_012751	A	9	9	620	628	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_012751	CTTT	2	8	630	637	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_012751	TTTA	2	8	642	649	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_012751	AT	3	6	684	689	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_012751	ATT	2	6	698	703	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_012751	TAA	2	6	768	773	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_012751	ATT	2	6	799	804	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_012751	T	6	6	811	816	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_012751	CTT	2	6	853	858	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	238897253
27	NC_012751	A	7	7	903	909	100 %	0 %	0 %	0 %	238897253
28	NC_012751	ATA	2	6	938	943	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238897253
29	NC_012751	TCC	2	6	945	950	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	238897253
30	NC_012751	TTA	2	6	957	962	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238897253
31	NC_012751	CAAAAA	2	12	968	979	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	238897253
32	NC_012751	A	7	7	975	981	100 %	0 %	0 %	0 %	238897253
33	NC_012751	ATG	2	6	992	997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238897253
34	NC_012751	TTG	2	6	1046	1051	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	238897253
35	NC_012751	ATT	2	6	1077	1082	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238897253
36	NC_012751	A	6	6	1089	1094	100 %	0 %	0 %	0 %	238897253
37	NC_012751	AAG	2	6	1142	1147	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	238897253
38	NC_012751	A	7	7	1194	1200	100 %	0 %	0 %	0 %	238897253
39	NC_012751	A	7	7	1209	1215	100 %	0 %	0 %	0 %	238897253
40	NC_012751	GAC	2	6	1219	1224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238897253
41	NC_012751	GA	3	6	1490	1495	50 %	0 %	50 %	0 %	238897253
42	NC_012751	TAAT	2	8	1502	1509	50 %	50 %	0 %	0 %	238897253
43	NC_012751	TTA	2	6	1525	1530	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238897253
44	NC_012751	AAG	2	6	1541	1546	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	238897253
45	NC_012751	TTGGT	2	10	1572	1581	0 %	60 %	40 %	0 %	238897253
46	NC_012751	GTG	2	6	1607	1612	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	238897253
47	NC_012751	TAG	2	6	1631	1636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238897253
48	NC_012751	AG	3	6	1635	1640	50 %	0 %	50 %	0 %	238897253
49	NC_012751	A	6	6	1674	1679	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_012751	T	7	7	1716	1722	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_012751	TTA	2	6	1761	1766	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_012751	A	6	6	1766	1771	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_012751	TGA	2	6	1817	1822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238897254
54	NC_012751	AT	3	6	1838	1843	50 %	50 %	0 %	0 %	238897254
55	NC_012751	TTA	2	6	1867	1872	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238897254
56	NC_012751	T	6	6	1900	1905	0 %	100 %	0 %	0 %	238897254
57	NC_012751	TTA	2	6	1911	1916	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238897254
58	NC_012751	T	7	7	1921	1927	0 %	100 %	0 %	0 %	238897254
59	NC_012751	ATT	2	6	2006	2011	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238897254
60	NC_012751	T	9	9	2020	2028	0 %	100 %	0 %	0 %	238897254
61	NC_012751	T	6	6	2101	2106	0 %	100 %	0 %	0 %	238897254
62	NC_012751	ACTTT	2	10	2107	2116	20 %	60 %	0 %	20 %	238897254
63	NC_012751	A	7	7	2227	2233	100 %	0 %	0 %	0 %	238897254
64	NC_012751	AT	3	6	2330	2335	50 %	50 %	0 %	0 %	238897254
65	NC_012751	TAT	2	6	2339	2344	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238897254
66	NC_012751	TTC	2	6	2351	2356	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	238897254
67	NC_012751	TA	3	6	2458	2463	50 %	50 %	0 %	0 %	238897254
68	NC_012751	CAT	2	6	2502	2507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238897254
69	NC_012751	TTC	2	6	2515	2520	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	238897254
70	NC_012751	AGG	2	6	2604	2609	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	238897255
71	NC_012751	AGC	2	6	2610	2615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238897255
72	NC_012751	T	6	6	2737	2742	0 %	100 %	0 %	0 %	238897255
73	NC_012751	TTA	2	6	2756	2761	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238897255
74	NC_012751	T	6	6	2768	2773	0 %	100 %	0 %	0 %	238897255
75	NC_012751	TTA	2	6	2785	2790	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238897255
76	NC_012751	TGT	2	6	2829	2834	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	238897255
77	NC_012751	GCTT	2	8	2841	2848	0 %	50 %	25 %	25 %	238897255
78	NC_012751	GGTCAG	2	12	2902	2913	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	238897255
79	NC_012751	TCAA	2	8	3008	3015	50 %	25 %	0 %	25 %	238897255
80	NC_012751	TTG	2	6	3053	3058	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	238897255
81	NC_012751	TTAT	2	8	3143	3150	25 %	75 %	0 %	0 %	238897255
82	NC_012751	TTTAT	3	15	3146	3160	20 %	80 %	0 %	0 %	238897255
83	NC_012751	ATT	2	6	3185	3190	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238897255
84	NC_012751	A	6	6	3196	3201	100 %	0 %	0 %	0 %	238897255
85	NC_012751	AAT	2	6	3214	3219	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_012751	T	6	6	3277	3282	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_012751	TGT	2	6	3311	3316	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_012751	TGA	2	6	3321	3326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_012751	TAT	2	6	3350	3355	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_012751	G	6	6	3384	3389	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
91	NC_012751	ATTTTG	2	12	3414	3425	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_012751	T	7	7	3478	3484	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_012751	CTA	2	6	3578	3583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_012751	A	6	6	3655	3660	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_012751	T	8	8	3710	3717	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_012751	TAA	2	6	3739	3744	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_012751	CCT	2	6	3758	3763	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_012751	T	6	6	3771	3776	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_012751	CTG	2	6	3800	3805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_012751	CTTT	2	8	3863	3870	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
101	NC_012751	T	6	6	3941	3946	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_012751	TGCT	2	8	3982	3989	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
103	NC_012751	T	7	7	4010	4016	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_012751	ATG	2	6	4017	4022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_012751	ATA	2	6	4179	4184	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_012751	T	7	7	4346	4352	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_012751	T	6	6	4354	4359	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_012751	T	7	7	4403	4409	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_012751	T	6	6	4431	4436	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_012751	G	6	6	4440	4445	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
111	NC_012751	A	7	7	4458	4464	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_012751	TTA	2	6	4481	4486	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_012751	GCT	2	6	4513	4518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_012751	GAAA	2	8	4528	4535	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
115	NC_012751	ATC	2	6	4571	4576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238897256
116	NC_012751	A	6	6	4616	4621	100 %	0 %	0 %	0 %	238897256
117	NC_012751	AAAC	2	8	4657	4664	75 %	0 %	0 %	25 %	238897256
118	NC_012751	AAT	2	6	4744	4749	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238897256
119	NC_012751	A	7	7	4876	4882	100 %	0 %	0 %	0 %	238897256
120	NC_012751	GTA	2	6	4924	4929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238897256
121	NC_012751	CCT	2	6	4952	4957	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	238897256
122	NC_012751	A	6	6	4969	4974	100 %	0 %	0 %	0 %	238897256
123	NC_012751	TAA	2	6	4991	4996	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238897256
124	NC_012751	ATT	2	6	4997	5002	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238897256
125	NC_012751	T	7	7	5001	5007	0 %	100 %	0 %	0 %	238897256
126	NC_012751	CCT	2	6	5020	5025	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
127	NC_012751	CAT	2	6	5054	5059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_012751	T	7	7	5063	5069	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_012751	A	7	7	5071	5077	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_012751	TTC	2	6	5121	5126	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_012751	ATT	2	6	5170	5175	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_012751	A	8	8	5193	5200	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_012751	A	7	7	5202	5208	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_012751	A	9	9	5216	5224	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_012751	GAAA	2	8	5225	5232	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NC_012751	A	8	8	5230	5237	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_012751	GCT	2	6	5238	5243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238897257
138	NC_012751	AT	4	8	5246	5253	50 %	50 %	0 %	0 %	238897257
139	NC_012751	AGA	3	9	5256	5264	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	238897257
140	NC_012751	T	6	6	5286	5291	0 %	100 %	0 %	0 %	238897257
141	NC_012751	T	8	8	5301	5308	0 %	100 %	0 %	0 %	238897257
142	NC_012751	T	7	7	5384	5390	0 %	100 %	0 %	0 %	238897257
143	NC_012751	TAA	3	9	5398	5406	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238897257
144	NC_012751	TGAG	2	8	5454	5461	25 %	25 %	50 %	0 %	238897257
145	NC_012751	TCT	2	6	5508	5513	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	238897257
146	NC_012751	T	6	6	5534	5539	0 %	100 %	0 %	0 %	238897257
147	NC_012751	A	7	7	5547	5553	100 %	0 %	0 %	0 %	238897257
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